La unidad de farmacovigilancia es una entidad constituida por profesionales de la salud que desarrollan actividades de supervisión en la seguridad de los medicamentos, incluidos los medicamentos biológicos y biotecnológicos desarrollados por la UDIMEB, con el fin de determinar el balance beneficio/riesgo durante el desarrollo de las diferentes fases de investigación clínica.

Las actividades de farmacovigilancia garantizan en todo momento la autenticidad y la calidad de los datos recogidos, la confidencialidad y privacidad de la información relativa a la identidad de los pacientes que hayan presentado o notificando eventos adversos o reacciones adversas y el uso de criterios uniformes en la evaluación de las notificaciones y en la generación de señales.